Микроскопия окрашенного мазка спинномозговой жидкости позволяет выявить микробную флору у 10-20% больных бактериальными менингитами. При бактериальных менингитах могут быть обнаружены менинго-, диплококки бобовидной формы, расположенные внутриклеточно в цитоплазме нейтрофилов, или пневмококки, которые тоже представляют собой диплококки, но имеют треугольную форму, причём пара кокков образует ромб (покрыты капсулой, располагаются внеклеточно).

В норме в спинномозговой жидкости содержится 0,1-0,3 г/л белка, главным образом альбумина. При нейроинфекциях и других патологических процессах количество белка при повышении проницаемости гематоликворного барьера увеличивается за счёт попадания его из плазмы крови. При вирусных нейроинфекциях содержание белка может достигать 0,6-1,5 г/л, при бактериальных - 3,0-6,0 г/л, а в поздние сроки - до 16-20 г/л.

Общий анализ спинномозговой жидкости включает подсчёт количества и состав форменных элементов крови. В норме в 1 мкл спинномозговой жидкости содержится 4-6 клеток (лимфоцитов). При патологических процессах (воспаление оболочек мозга, энцефалит, объёмные процессы, острая недостаточность мозгового кровообращения) количество клеточных элементов увеличивается.